西紅柿一直是一種比較難保存的蔬菜，西紅柿可以利用冷庫和氣調庫進行保鮮，一般西紅柿冷庫保 鮮的周期為10-15天(紅熟果實)，30-35天(綠果實)。如果利用西紅柿氣調庫進行保存那么長達45天。
西紅柿保鮮冷庫溫度:
紅熟果實:溫度10~13℃，儲存時間10~15天;
綠熟果實:溫度10~13℃，儲存時間30~35天。
西紅柿氣調庫溫度參數:
溫度:10~13℃，氧氣含量:2%~4%，二氧化碳:3%~6%，保鮮時間:45天。
注意:番茄在成熟過程中會產生乙烯，及時降低貯藏環境中乙烯的含量可以減緩番茄的成熟速度，庫內的濕度應該保持在85%~90%之間，溫度不要太低，防止凍害的發生。除了以上的方式還可以將西紅柿進行速凍保存，一般方法以下兩種:
1.選擇成熟適宜的果實作原料，將有病蟲害、開裂、畸形或未成熟的剔除，用0.5%~1.0%的食用氯化鈣溶液侵泡20分鐘，瀝于表面的水分，在-30℃以下的凍結隧道內凍結，采用這種方法凍結速度不宜太快，否則會出現脆裂，影響品質。
2.凍結前的加工同方法一。在-30℃以下凍結10min后，立即置入30~35℃的水中，使西紅柿表皮開裂，人工剝皮，定量裝入塑料袋內，再在-30℃以下進行凍結，使其中心溫度凍結到貯藏溫度-18℃.
